Ян Хоймейкерс изучает воздействия на репарацию ДНК и стабильность генома млекопитающих. В частности, он клонировал первый из многих человеческих генов репарации ДНК и обнаружил существенную эволюционную консервативность систем репарации ДНК вообще. Это обеспечило основание для разъяснения механизма репарации путем вырезания нуклеотидов (NER). Кроме того, он установил молекулярные основы множества человеческих NER синдромов. Его команда внесла большой вклад в изучение стабильности генома. Ян Хоймейкерс установил функцию ключевых факторов в NER, например, роль комплекса ERCC1/XPF эндонуклеазы, показал, что XPC комплекс — первичный фактор узнавания повреждения и обнаружил новый механизм регулирования NER повреждением ДНК.Некоторые мыши несут те же самые мутации, которые найдены у