Перевести на Переведено сервисом «Яндекс.Перевод»

Моделирование аггрегации белков и поведения живых систем

Николай Дохолян изучает динамику белков и исследует вопрос, как индуцированные изменения в фолдинге (сворачивании, укладке, от англ. folding) белка, а также агрегация белков могут привести к той или иной болезни. Одним из таких примеров может служить неправильнoe сворачиваниe супероксид дисмутазы (SOD1), которoe ассоциированно с нейродегенеративным заболеванием двигательных нейронов — боковым амиотрофическим склерозом (Amyotrophic Lateral Sclerosis). Формирование токсичных агрегатов SOD1 наблюдается и при семейной, и при спорадической (т. е. не обусловленной какими-то специфическими мутациями) формах этого заболевания. Цель исследований лаборатории Дохоляна — выяснить причины токсичности мутантной формы SOD1 на молекулярном уровне, используя комбинацию вычислительных и экспериментальных методов. Кроме того, используя быстрый метод дискретной молекулярной динамики, в лаборатории исследуется структура агрегатов SOD1. Знание структуры агрегатов необходимо для определения малых молекул, которые могут предотвратить или разрушить формирование этих токсичных скоплений. Определение структурных и функциональных характеристик белка напрямую связано с тем, насколько хорошо определена его пространственная структура. В лаборатории ведутся исследования, связанные с разработкой быстрых и точных методов предсказания пространственной структуры (фолдинга) белка. Успех этих исследований позволит более эффективно разрабатывать лекарства с высокой степенью специфичности.

Место работы — Отделение биологии клетки и биологии развития, Университет Северной Каролины (Department of Cell and Developmental Biology, University of North Carolina), США
Контакты — University of North Carolina at Chapel Hill, School of Medicine, Chapel Hill, NC 27517, USA(919) 843-2513dokh@med.unc.eduhttp://danger.med.unc.edu/index.php
Публикации — Modifications of SOD1 in human erythrocytes: A possible role in ALS. Wilcox, K. C., Zhou, L., Jordon, J., Huang, Y., Yu, Y., Redler, R. L., Chen, X., Caplow, M., and Dokholyan, N. v. Journal of Biological Chemistry. 2009; 284:13940-13947Probing protein aggregation using discrete molecular dynamics. Sharma, S., Ding, F., and Dokholyan, N. v. Frontier in Bioscience. 2008; 13:4795-4808Molecular mechanisms of polypeptide aggregation in human diseases. Khare, S. D., and Dokholyan, N. v. Current Protein & Peptide Science. 2007; 8:573–579

Исследовательские группы

Дохолян, Николай